Ingénieur scientifique contractuel /Développement logiciel d’un plugin dans medInria dans le contexte de la recherche
Inria
Talence, Gironde
Ingénieur scientifique contractuel /Développement logiciel d'un plugin dans medInria dans le contexte de la recherche
Type de contrat : CDD
Contrat renouvelable : Oui
Niveau de diplôme exigé : Bac + 5 ou équivalent
Fonction : Ingénieur scientifique contractuel
Niveau d'expérience souhaité : Jeune diplômé
A propos du centre ou de la direction fonctionnelle
Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique…
Contexte et atouts du poste
Dans le cadre du plan France Relance et France 2030, le Gouvernement a mis en place la Stratégie Nationale d’Accélération en Santé Numérique (SASN) dont le volet recherche est porté par le Programme Equipement Prioritaire de Recherche en Santé Numérique (PEPR SN).
Dans ce contexte, l’Etat a confié à l’Inserm et Inria le pilotage scientifique de ce programme.
L’ objectif est de développer des modèles multi-échelles, des capteurs, ainsi que des outils et méthodes innovantes afin de produire, gérer et exploiter au mieux les volumes croissants de données de santé hétérogènes, au bénéfice des patients et des soignants.
Cela permettra L’amélioration des capacités d’acquisition d’observations multi-échelles, c’est-à-dire, dans l’espace et dans le temps mais aussi La construction de jumeaux numériques multi-échelles du patient.
Le PEPR SN est scindé en 4 programmes de recherche pour 17 projets ciblés.
Le poste à pourvoir concerne le projet ChroniCardio.
C'est un des projets ciblés du programme 3 dont l'objectif est d'améliorer l’observabilité multi-échelle et prédire les maladies cardiovasculaires.
Son ambition est de mieux comprendre la cardiomyopathie non-ischiémique chronique et de permettre une prédiction à long terme à l'aide de données et de modèles multi-echelle .
Mission confiée
medInria est un logiciel multi-plateforme et open-source de traitement et de visualisation d'images médicales à destination des chercheurs en santé numérique et des cliniciens.
L'objectif est de permettre une collaboration facilitée entre le monde de la recherche et l'hopital. Il permet d'une part de mettre à disposition des cliniciens les algorithmes de traitements développés dans les équipes de recherche de l'Inria. Et d'autre part d'alimenter la recherche avec les données produites par les cliniciens.
Le format BIDS (Brain Imaging Data Structure) est une manière simple et intuitive d'organiser et décrire les données d'imagerie.
Le rôle de la personne recrutée sera de finaliser le développement d'un plugin permettant d'interfacer medInria avec une arborescence de type BIDS.
Il devra participer à un enrichissement de la norme BIDS dans le contexte de l'éléctro-physiologie cardiaque.
La personne recrutée collaborera avec une équipe de cliniciens du CHU de Bordeaux, en particulier des radiologues. Il devra coordonner ses développements avec les membres de l'équipe Multimodal Data Science (MDS) au sein de l'IHU Liryc à Pessac.
Principales activités
- Développement logiciel
- Veille technologique
- Documentation
Compétences
Compétences techniques et niveau requis :
Connaissances solides et expérience en développement logiciel:
Maîtrise des langages :
- C++ (Qt serait un plus)
- python
- Base de données :
- mongodb
- Architecture logicielle et paradigmes de programmation, génie logiciel, bonnes pratiques et outils de développement logiciel
- Gestionnaire de version git
- Documentation doxygen
- Compilation avec CMake
medInria est un logiciel multi-plateforme (Linux, Windows, MacOs).
Le développement pourra être effectué au choix sur l'un de ces OS.
Le candidat devra veiller à la portabilité sur tous les OS supportés.
Avantages
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail partiel et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
Rémunération
La rémunération est fixée selon les diplômes obtenus et les expériences professionnelles :
entre 2692 euros et 3085 euros bruts mensuels